外泌體(Exosome)是由不同細胞分泌的直徑30-150nm 的胞外膜性囊泡(Extrocellular Visicles,EVs)。外泌體普遍存在于多種體液中,其內(nèi)容物豐富,包括蛋白質(zhì)、脂質(zhì)和核酸等,在細胞間信息交流中發(fā)揮著重要作用。近年來,液體活檢作為一種新的非侵入式主要檢測血液中循環(huán)腫瘤細胞(Circulating Tumor Cell,CTC)和循環(huán)腫瘤DNA(Circulating Tumor DNA,ctDNA),獲取患者腫瘤病變信息,用以幫助診斷治療。研究表明,在外泌體中已檢測到基因組DNA 和線粒體DNA,通過提取和檢測外泌體中DNA突變,可作為液體活檢的另一種選擇。
外泌體提取和DNA分離試劑盒(Exosome Extraction & DNA Isolation Kit)結(jié)合我們的外泌體提取試劑,能夠從細胞培養(yǎng)上清或體液(血清/血漿等)中同時分離外泌體和循環(huán)DNA。利用優(yōu)化的裂解液提取已分離的外泌體DNA,采用吸附柱(Spin Columns)法方便、快捷地純化、洗脫外泌體DNA,可直接用于下游應(yīng)用,如real time PCR,Expression Array Assays,NGS等。
可獲得回收率、高純度游離DNA和外泌體相關(guān)DNA。
操作簡單、快捷,不需要額外儀器設(shè)備。
可小體積洗脫。
適合后續(xù)各種DNA實驗,如qPCR或數(shù)字
可簡單、快速富集各種樣本中游離DNA和外泌體顆粒。
可通過DNase I處理降解樣本中游離DNA,而外泌體中DNA不受影響,可單獨純化外泌體中DNA。
可應(yīng)用qPCR或數(shù)字PCR檢測和發(fā)現(xiàn)突變,應(yīng)用于液體活檢。
提取的DNA可用于構(gòu)建文庫及測序。
收集臨床診斷為腸癌患者,應(yīng)用“外泌體提取和DNA分離試劑盒”中外泌體提取試劑沉淀血漿中外泌體顆粒,分別經(jīng)過Dnase I處理和不經(jīng)過Dnase I處理來區(qū)分提取的外泌體相關(guān)DNA,應(yīng)用安捷倫2100 Bioanalyzer測定DNA分布圖(圖1),從中得出:外泌體提取試劑不僅能富集血漿中外泌體顆粒,同時血漿中游離DNA也能被沉淀下來,經(jīng)過Dnase I消化,可以降解血漿中游離DNA,但外泌體膜性結(jié)構(gòu)可阻止Dnase I對外泌體內(nèi)含物DNA消化。以提取的DNA為模板,應(yīng)用ARMS-PCR技術(shù)對KRas突變檢測(圖2),在KRas突變的腸癌患者中,檢測的Ct值較健康人小,同時經(jīng)過Dnase I處理,可提高腸癌患者與健康人Ct值差值(△Ct)檢測的特異性和靈敏度。
圖1:DnaseⅠ處理對外泌體相關(guān)DNA提取的影響
圖2:DnaseⅠ處理可提高外泌體相關(guān)DNA突變檢測的特異性
潤基生物在外泌體提取和DNA/RNA分離純化方面積累了豐富經(jīng)驗,結(jié)合我們的實驗條件,可以提供:
1、外泌體的提取和純化,外泌體定量(NTA和ELISA)。
2、外泌體核酸分離和純化,外泌體核酸檢測(qPCR或NGS)。
3、外泌體蛋白質(zhì)鑒定,如Western Blot,蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析等。